Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HDGFP51858 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HDGFP51858 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HDGFP51858 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HDGFP51858 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HDGFP51858 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HDGFP51858 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HDGFP51858 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HDGFP51858 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HDGFP51858 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HDGFP51858 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HDGFP51858 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HDGFP51858 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HDGFP51858 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HDGFP51858 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HDGFP51858 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDGFP51858 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HDGFP51858 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDGFP51858 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDGFP51858 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDGFP51858 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDGFP51858 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HDGFP51858 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HDGFP51858 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HDGFP51858 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HDGFP51858 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HDGFP51858 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HDGFP51858 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HDGFP51858 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HDGFP51858 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HDGFP51858 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HDGFP51858 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HDGFP51858 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HDGFP51858 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HDGFP51858 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HDGFP51858 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDGFP51858 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDGFP51858 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDGFP51858 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDGFP51858 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDGFP51858 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HDGFP51858 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HDGFP51858 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HDGFP51858 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HDGFP51858 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HDGFP51858 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HDGFP51858 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HDGFP51858 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HDGFP51858 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HDGFP51858 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HDGFP51858 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HDGFP51858 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
HDGFP51858 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
HDGFP51858 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
HDGFP51858 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HDGFP51858 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDGFP51858 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDGFP51858 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDGFP51858 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDGFP51858 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDGFP51858 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HDGFP51858 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
HDGFP51858 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
HDGFP51858 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HDGFP51858 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HDGFP51858 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.82■■■■□ 3
HDGFP51858 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HDGFP51858 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HDGFP51858 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.81■■■■□ 3
HDGFP51858 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
HDGFP51858 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HDGFP51858 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
HDGFP51858 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HDGFP51858 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.8■■■■□ 3
HDGFP51858 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms