Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLAP51003 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLAP51003 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms