Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF10P50591 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF10P50591 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms