Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX5P50542 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX5P50542 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX5P50542 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX5P50542 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX5P50542 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX5P50542 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX5P50542 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX5P50542 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX5P50542 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX5P50542 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX5P50542 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX5P50542 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX5P50542 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX5P50542 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX5P50542 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX5P50542 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX5P50542 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX5P50542 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX5P50542 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX5P50542 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX5P50542 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX5P50542 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX5P50542 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX5P50542 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX5P50542 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX5P50542 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX5P50542 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX5P50542 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX5P50542 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX5P50542 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms