Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLK3P49761 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK3P49761 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK3P49761 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK3P49761 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK3P49761 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK3P49761 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK3P49761 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK3P49761 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK3P49761 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK3P49761 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK3P49761 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK3P49761 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK3P49761 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK3P49761 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK3P49761 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK3P49761 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK3P49761 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK3P49761 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK3P49761 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK3P49761 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK3P49761 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK3P49761 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK3P49761 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK3P49761 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK3P49761 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK3P49761 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK3P49761 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK3P49761 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK3P49761 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK3P49761 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK3P49761 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK3P49761 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK3P49761 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK3P49761 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK3P49761 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK3P49761 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK3P49761 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK3P49761 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK3P49761 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK3P49761 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK3P49761 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK3P49761 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLK3P49761 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK3P49761 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK3P49761 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK3P49761 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms