Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTCFP49711 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTCFP49711 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTCFP49711 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTCFP49711 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CTCFP49711 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTCFP49711 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTCFP49711 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTCFP49711 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTCFP49711 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTCFP49711 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTCFP49711 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTCFP49711 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTCFP49711 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTCFP49711 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTCFP49711 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTCFP49711 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTCFP49711 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTCFP49711 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTCFP49711 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTCFP49711 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTCFP49711 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTCFP49711 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTCFP49711 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTCFP49711 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTCFP49711 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTCFP49711 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTCFP49711 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTCFP49711 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTCFP49711 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTCFP49711 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTCFP49711 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTCFP49711 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTCFP49711 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTCFP49711 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTCFP49711 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTCFP49711 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTCFP49711 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTCFP49711 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTCFP49711 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTCFP49711 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTCFP49711 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTCFP49711 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTCFP49711 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTCFP49711 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTCFP49711 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTCFP49711 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTCFP49711 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CTCFP49711 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CTCFP49711 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTCFP49711 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CTCFP49711 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CTCFP49711 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTCFP49711 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTCFP49711 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTCFP49711 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTCFP49711 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTCFP49711 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTCFP49711 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTCFP49711 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTCFP49711 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms