Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGM4P49221 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM4P49221 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM4P49221 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM4P49221 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM4P49221 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM4P49221 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGM4P49221 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGM4P49221 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM4P49221 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM4P49221 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TGM4P49221 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGM4P49221 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TGM4P49221 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TGM4P49221 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TGM4P49221 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TGM4P49221 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGM4P49221 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TGM4P49221 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TGM4P49221 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TGM4P49221 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM4P49221 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM4P49221 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM4P49221 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM4P49221 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM4P49221 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TGM4P49221 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TGM4P49221 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM4P49221 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms