Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1DP48730 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSNK1DP48730 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms