Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK1A1P48729 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSNK1A1P48729 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK1A1P48729 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms