Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RECQLP46063 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RECQLP46063 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RECQLP46063 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RECQLP46063 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RECQLP46063 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RECQLP46063 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RECQLP46063 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RECQLP46063 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RECQLP46063 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RECQLP46063 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RECQLP46063 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RECQLP46063 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RECQLP46063 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RECQLP46063 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RECQLP46063 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RECQLP46063 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RECQLP46063 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RECQLP46063 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RECQLP46063 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RECQLP46063 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RECQLP46063 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RECQLP46063 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RECQLP46063 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RECQLP46063 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RECQLP46063 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RECQLP46063 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RECQLP46063 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RECQLP46063 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RECQLP46063 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RECQLP46063 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RECQLP46063 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RECQLP46063 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms