Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL35P42766 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL35P42766 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL35P42766 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL35P42766 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL35P42766 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL35P42766 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL35P42766 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL35P42766 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL35P42766 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL35P42766 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL35P42766 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL35P42766 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL35P42766 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL35P42766 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL35P42766 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL35P42766 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL35P42766 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL35P42766 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL35P42766 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL35P42766 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL35P42766 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL35P42766 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL35P42766 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL35P42766 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL35P42766 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL35P42766 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL35P42766 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL35P42766 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL35P42766 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL35P42766 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL35P42766 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL35P42766 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL35P42766 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL35P42766 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL35P42766 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL35P42766 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL35P42766 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL35P42766 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL35P42766 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL35P42766 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL35P42766 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL35P42766 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL35P42766 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL35P42766 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL35P42766 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL35P42766 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL35P42766 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL35P42766 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms