Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms