Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA4P41247 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA4P41247 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA4P41247 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA4P41247 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms