Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPGP40121 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPGP40121 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPGP40121 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPGP40121 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPGP40121 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPGP40121 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPGP40121 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPGP40121 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPGP40121 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPGP40121 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPGP40121 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPGP40121 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPGP40121 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPGP40121 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPGP40121 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPGP40121 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPGP40121 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPGP40121 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPGP40121 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPGP40121 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPGP40121 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPGP40121 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPGP40121 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPGP40121 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPGP40121 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPGP40121 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPGP40121 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPGP40121 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPGP40121 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPGP40121 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPGP40121 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPGP40121 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPGP40121 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPGP40121 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPGP40121 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPGP40121 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPGP40121 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPGP40121 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPGP40121 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPGP40121 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPGP40121 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPGP40121 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPGP40121 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPGP40121 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPGP40121 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPGP40121 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPGP40121 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPGP40121 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPGP40121 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPGP40121 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPGP40121 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPGP40121 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPGP40121 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPGP40121 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPGP40121 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPGP40121 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPGP40121 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPGP40121 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPGP40121 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms