Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IGHMBP2P38935 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IGHMBP2P38935 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHMBP2P38935 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms