Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETFBP38117 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETFBP38117 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETFBP38117 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETFBP38117 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETFBP38117 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETFBP38117 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETFBP38117 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETFBP38117 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETFBP38117 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETFBP38117 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETFBP38117 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ETFBP38117 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ETFBP38117 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ETFBP38117 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ETFBP38117 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ETFBP38117 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETFBP38117 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETFBP38117 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETFBP38117 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETFBP38117 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETFBP38117 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETFBP38117 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETFBP38117 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETFBP38117 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETFBP38117 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETFBP38117 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETFBP38117 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETFBP38117 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETFBP38117 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ETFBP38117 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ETFBP38117 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ETFBP38117 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETFBP38117 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETFBP38117 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETFBP38117 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETFBP38117 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETFBP38117 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETFBP38117 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETFBP38117 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETFBP38117 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETFBP38117 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETFBP38117 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETFBP38117 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETFBP38117 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETFBP38117 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETFBP38117 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETFBP38117 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETFBP38117 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETFBP38117 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETFBP38117 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms