Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZEB1P37275 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZEB1P37275 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZEB1P37275 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms