Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX5P35711 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SOX5P35711 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOX5P35711 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX5P35711 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX5P35711 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX5P35711 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX5P35711 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX5P35711 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX5P35711 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX5P35711 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX5P35711 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX5P35711 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX5P35711 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX5P35711 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX5P35711 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX5P35711 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX5P35711 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX5P35711 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX5P35711 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX5P35711 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX5P35711 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX5P35711 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX5P35711 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX5P35711 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX5P35711 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX5P35711 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX5P35711 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX5P35711 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX5P35711 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX5P35711 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX5P35711 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX5P35711 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX5P35711 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX5P35711 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX5P35711 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX5P35711 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX5P35711 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX5P35711 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX5P35711 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX5P35711 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOX5P35711 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX5P35711 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX5P35711 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX5P35711 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms