Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN2P35609 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN2P35609 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms