Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFN2P35080 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFN2P35080 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFN2P35080 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFN2P35080 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFN2P35080 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFN2P35080 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFN2P35080 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFN2P35080 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFN2P35080 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFN2P35080 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFN2P35080 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFN2P35080 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFN2P35080 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFN2P35080 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFN2P35080 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms