Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG3P32926 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG3P32926 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG3P32926 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG3P32926 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG3P32926 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG3P32926 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSG3P32926 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSG3P32926 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG3P32926 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG3P32926 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG3P32926 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG3P32926 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSG3P32926 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSG3P32926 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSG3P32926 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSG3P32926 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSG3P32926 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSG3P32926 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG3P32926 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG3P32926 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG3P32926 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG3P32926 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG3P32926 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG3P32926 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DSG3P32926 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG3P32926 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG3P32926 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG3P32926 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG3P32926 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG3P32926 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSG3P32926 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSG3P32926 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG3P32926 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DSG3P32926 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG3P32926 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG3P32926 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG3P32926 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG3P32926 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG3P32926 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG3P32926 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSG3P32926 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSG3P32926 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DSG3P32926 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG3P32926 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG3P32926 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG3P32926 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG3P32926 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG3P32926 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG3P32926 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSG3P32926 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSG3P32926 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSG3P32926 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms