Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR1P32246 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR1P32246 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR1P32246 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR1P32246 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR1P32246 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR1P32246 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR1P32246 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR1P32246 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR1P32246 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR1P32246 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR1P32246 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR1P32246 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR1P32246 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR1P32246 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR1P32246 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR1P32246 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR1P32246 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR1P32246 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR1P32246 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR1P32246 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCR1P32246 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCR1P32246 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCR1P32246 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR1P32246 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR1P32246 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR1P32246 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR1P32246 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR1P32246 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR1P32246 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR1P32246 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR1P32246 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR1P32246 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR1P32246 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR1P32246 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR1P32246 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR1P32246 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR1P32246 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR1P32246 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR1P32246 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR1P32246 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR1P32246 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR1P32246 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR1P32246 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR1P32246 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR1P32246 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR1P32246 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR1P32246 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR1P32246 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR1P32246 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR1P32246 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR1P32246 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR1P32246 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR1P32246 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms