Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC8P31273 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC8P31273 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms