Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRABP2P29373 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRABP2P29373 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP2P29373 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms