Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTFP26441 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTFP26441 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTFP26441 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTFP26441 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTFP26441 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTFP26441 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTFP26441 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTFP26441 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTFP26441 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTFP26441 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTFP26441 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTFP26441 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTFP26441 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTFP26441 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNTFP26441 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTFP26441 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTFP26441 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTFP26441 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTFP26441 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTFP26441 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTFP26441 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTFP26441 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTFP26441 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTFP26441 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTFP26441 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTFP26441 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTFP26441 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTFP26441 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTFP26441 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTFP26441 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTFP26441 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTFP26441 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTFP26441 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTFP26441 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTFP26441 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTFP26441 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTFP26441 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms