Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP11P24347 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP11P24347 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP11P24347 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP11P24347 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP11P24347 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP11P24347 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP11P24347 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP11P24347 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP11P24347 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP11P24347 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP11P24347 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP11P24347 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP11P24347 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP11P24347 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP11P24347 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP11P24347 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP11P24347 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP11P24347 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP11P24347 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP11P24347 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP11P24347 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP11P24347 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP11P24347 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP11P24347 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP11P24347 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP11P24347 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP11P24347 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP11P24347 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP11P24347 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP11P24347 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP11P24347 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP11P24347 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP11P24347 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP11P24347 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms