Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PTPRGP23470 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRGP23470 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRGP23470 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
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