Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLDCP23378 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLDCP23378 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLDCP23378 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLDCP23378 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLDCP23378 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLDCP23378 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLDCP23378 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLDCP23378 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLDCP23378 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLDCP23378 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLDCP23378 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLDCP23378 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLDCP23378 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GLDCP23378 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLDCP23378 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLDCP23378 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLDCP23378 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLDCP23378 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLDCP23378 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLDCP23378 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLDCP23378 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLDCP23378 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLDCP23378 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLDCP23378 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLDCP23378 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLDCP23378 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLDCP23378 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLDCP23378 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLDCP23378 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLDCP23378 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLDCP23378 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLDCP23378 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLDCP23378 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLDCP23378 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLDCP23378 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLDCP23378 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GLDCP23378 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLDCP23378 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLDCP23378 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLDCP23378 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLDCP23378 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLDCP23378 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLDCP23378 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLDCP23378 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLDCP23378 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLDCP23378 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLDCP23378 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLDCP23378 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLDCP23378 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLDCP23378 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLDCP23378 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLDCP23378 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLDCP23378 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLDCP23378 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLDCP23378 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLDCP23378 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLDCP23378 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLDCP23378 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLDCP23378 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLDCP23378 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms