Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HRCP23327 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HRCP23327 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HRCP23327 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HRCP23327 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HRCP23327 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HRCP23327 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HRCP23327 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HRCP23327 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HRCP23327 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HRCP23327 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HRCP23327 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HRCP23327 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HRCP23327 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HRCP23327 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HRCP23327 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HRCP23327 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HRCP23327 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HRCP23327 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HRCP23327 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HRCP23327 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HRCP23327 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HRCP23327 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HRCP23327 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HRCP23327 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HRCP23327 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HRCP23327 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HRCP23327 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HRCP23327 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HRCP23327 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
HRCP23327 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
HRCP23327 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HRCP23327 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HRCP23327 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HRCP23327 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
HRCP23327 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HRCP23327 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HRCP23327 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HRCP23327 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HRCP23327 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HRCP23327 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HRCP23327 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HRCP23327 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HRCP23327 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HRCP23327 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HRCP23327 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HRCP23327 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HRCP23327 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HRCP23327 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
HRCP23327 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HRCP23327 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HRCP23327 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HRCP23327 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HRCP23327 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HRCP23327 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HRCP23327 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
HRCP23327 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HRCP23327 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HRCP23327 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HRCP23327 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HRCP23327 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HRCP23327 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
HRCP23327 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HRCP23327 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HRCP23327 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HRCP23327 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HRCP23327 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HRCP23327 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HRCP23327 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HRCP23327 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HRCP23327 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HRCP23327 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HRCP23327 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HRCP23327 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
HRCP23327 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HRCP23327 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HRCP23327 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms