Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHBP21912 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHBP21912 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHBP21912 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHBP21912 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHBP21912 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHBP21912 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHBP21912 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHBP21912 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHBP21912 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHBP21912 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHBP21912 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHBP21912 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHBP21912 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHBP21912 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHBP21912 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHBP21912 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHBP21912 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHBP21912 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHBP21912 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHBP21912 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHBP21912 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHBP21912 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHBP21912 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHBP21912 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHBP21912 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHBP21912 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHBP21912 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHBP21912 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHBP21912 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHBP21912 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHBP21912 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHBP21912 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHBP21912 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHBP21912 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHBP21912 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHBP21912 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHBP21912 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHBP21912 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHBP21912 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHBP21912 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHBP21912 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHBP21912 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHBP21912 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHBP21912 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHBP21912 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHBP21912 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHBP21912 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHBP21912 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHBP21912 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHBP21912 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHBP21912 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHBP21912 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHBP21912 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHBP21912 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHBP21912 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHBP21912 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHBP21912 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHBP21912 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHBP21912 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDHBP21912 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHBP21912 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHBP21912 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHBP21912 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHBP21912 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHBP21912 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms