Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPHA1P21709 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPHA1P21709 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms