Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGCP20142 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGCP20142 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGCP20142 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGCP20142 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGCP20142 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PGCP20142 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PGCP20142 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PGCP20142 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PGCP20142 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGCP20142 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGCP20142 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGCP20142 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGCP20142 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGCP20142 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGCP20142 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGCP20142 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGCP20142 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PGCP20142 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PGCP20142 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGCP20142 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGCP20142 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGCP20142 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGCP20142 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGCP20142 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PGCP20142 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGCP20142 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGCP20142 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGCP20142 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGCP20142 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGCP20142 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.6 ms