Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN1P20061 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN1P20061 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN1P20061 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN1P20061 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN1P20061 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN1P20061 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN1P20061 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN1P20061 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN1P20061 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN1P20061 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN1P20061 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN1P20061 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN1P20061 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN1P20061 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN1P20061 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN1P20061 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN1P20061 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN1P20061 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN1P20061 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN1P20061 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN1P20061 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN1P20061 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN1P20061 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN1P20061 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCN1P20061 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCN1P20061 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCN1P20061 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCN1P20061 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms