Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-DPA1P20036 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms