Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB1P19838 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFKB1P19838 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKB1P19838 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms