Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPI1P17947 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPI1P17947 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPI1P17947 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPI1P17947 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPI1P17947 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SPI1P17947 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPI1P17947 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPI1P17947 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPI1P17947 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPI1P17947 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPI1P17947 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPI1P17947 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPI1P17947 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPI1P17947 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPI1P17947 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPI1P17947 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPI1P17947 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SPI1P17947 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPI1P17947 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPI1P17947 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPI1P17947 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPI1P17947 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms