Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA2P17301 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA2P17301 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms