Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKCAP17252 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCAP17252 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms