Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHRP16473 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHRP16473 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHRP16473 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHRP16473 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHRP16473 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSHRP16473 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSHRP16473 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHRP16473 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHRP16473 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHRP16473 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHRP16473 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHRP16473 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHRP16473 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHRP16473 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHRP16473 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHRP16473 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHRP16473 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHRP16473 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHRP16473 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHRP16473 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHRP16473 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSHRP16473 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSHRP16473 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSHRP16473 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSHRP16473 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSHRP16473 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSHRP16473 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSHRP16473 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSHRP16473 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSHRP16473 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSHRP16473 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSHRP16473 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSHRP16473 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSHRP16473 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSHRP16473 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSHRP16473 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSHRP16473 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSHRP16473 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSHRP16473 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSHRP16473 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms