Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTLA4P16410 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms