Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYOD1P15172 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms