Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAFP15056 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAFP15056 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAFP15056 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAFP15056 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAFP15056 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAFP15056 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAFP15056 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAFP15056 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAFP15056 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAFP15056 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAFP15056 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAFP15056 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAFP15056 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAFP15056 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAFP15056 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAFP15056 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAFP15056 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAFP15056 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAFP15056 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAFP15056 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAFP15056 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAFP15056 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAFP15056 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAFP15056 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAFP15056 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAFP15056 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAFP15056 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAFP15056 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAFP15056 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAFP15056 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAFP15056 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAFP15056 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAFP15056 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAFP15056 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAFP15056 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms