Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDGF1P13385 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDGF1P13385 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDGF1P13385 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms