Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4P13236 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4P13236 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4P13236 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4P13236 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL4P13236 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL4P13236 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL4P13236 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL4P13236 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4P13236 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4P13236 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4P13236 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4P13236 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4P13236 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4P13236 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL4P13236 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL4P13236 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4P13236 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4P13236 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4P13236 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4P13236 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4P13236 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4P13236 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4P13236 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4P13236 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4P13236 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4P13236 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4P13236 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4P13236 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4P13236 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4P13236 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4P13236 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4P13236 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4P13236 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4P13236 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4P13236 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4P13236 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4P13236 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4P13236 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4P13236 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4P13236 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4P13236 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms