Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP2P12643 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP2P12643 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP2P12643 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP2P12643 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP2P12643 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP2P12643 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP2P12643 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP2P12643 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP2P12643 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP2P12643 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP2P12643 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP2P12643 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP2P12643 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP2P12643 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP2P12643 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP2P12643 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP2P12643 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP2P12643 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP2P12643 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP2P12643 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP2P12643 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP2P12643 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP2P12643 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP2P12643 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP2P12643 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP2P12643 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms