Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT3P12035 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT3P12035 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT3P12035 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT3P12035 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT3P12035 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT3P12035 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT3P12035 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT3P12035 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT3P12035 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT3P12035 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT3P12035 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT3P12035 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT3P12035 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT3P12035 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT3P12035 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT3P12035 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT3P12035 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT3P12035 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT3P12035 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT3P12035 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT3P12035 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT3P12035 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT3P12035 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT3P12035 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT3P12035 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT3P12035 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT3P12035 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT3P12035 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT3P12035 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT3P12035 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT3P12035 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT3P12035 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT3P12035 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT3P12035 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT3P12035 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT3P12035 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT3P12035 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT3P12035 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT3P12035 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT3P12035 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT3P12035 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT3P12035 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT3P12035 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT3P12035 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT3P12035 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT3P12035 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT3P12035 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT3P12035 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT3P12035 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT3P12035 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT3P12035 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT3P12035 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT3P12035 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT3P12035 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT3P12035 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT3P12035 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT3P12035 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT3P12035 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT3P12035 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT3P12035 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT3P12035 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT3P12035 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT3P12035 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT3P12035 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT3P12035 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT3P12035 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms