Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP1P11279 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms