Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGFB3P10600 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms