Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR89BP0CG08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GPR89BP0CG08 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR89BP0CG08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms