Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00869P0C866 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00869P0C866 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00869P0C866 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms